Η Ικαρία έχει δύο λιμάνια, ένα στη βόρεια και ένα στη νότια πλευρά, προκειμένου να εξυπηρετηθούν οι επισκέπτες σε όλο το νησί. Επίσης, υπάρχουν αρκετές μαρίνες και αλλιευτικά καταφύγια διασκορπισμένα στο νησί, όπου πλήθος καϊκιών φιλοξενούνται.