Agios Nikolaos - Rivière Ηalaris - Nas. Code: site d'importance communautaire (SIC). Sur le côté sud de l'île (Agios Nikolaos), les habitats rocheux calcaires avec des falaises abruptes sont introuvables. Dans ce domaine, une proportion importante de la flore endémique de l'île se trouve. Halaris est une rivière qui coule en permanence qui traverse l'île dans le sens sud-nord. Groupes riverains du plan entourent le lit de la rivière. Un site archéologique, le temple d'Artémis Tavropolos, est situé à l'embouchure de la rivière.
Fanari Ikaria. Code: GR4120004 (Natura 2000) et site d'importance communautaire (SIC). Fanari comprend de nombreux habitats marins. Types spécifiques d'habitats qui caractérisent les mers ouvertes, sont considérées comme typiques du milieu marin de la Méditerranée, avec les principaux représentants des plages de sable et Posidonia. La région est caractérisée aussi CORINE Biotope avec le code Ag0030072. Fanari est le Cap Nord de Ikaria avec des falaises abruptes et des plages de sable fin. La région est caractérisée par la stabilité, comme l'écosystème. Il est un domaine important pour le phoque moine de Méditerranée (Monachus monachus) et la tortue (Caretta caretta). Menace base du biotope est la pêche illégale.
Mont Atheras et Plagia. Code: GR4120004 (NATURA 2000) et site d'importance communautaire (SIC). La montagne Atheras (plus haut sommet 1.042 m) est délimitée dans la partie centrale de l'île et se compose essentiellement de schistes. La présence fréquente de brouillard et les formations nuageuses, de créer l'humidité relative la plus élevée, même en été. Aux points, le type ouvert de la végétation est le résultat de pâturage. Les gommages et quelques zones protégées, montrent que l'île était autrefois couverte de forêts. Il est également un biotope de CORINE avec le code Ag0040069. La zone se dégrade lentement. Les falaises de calcaire abritent des plantes endémiques locales. La région possède des grottes marines, où Monachus monachus se trouve. Principales menaces dans la région sont le pâturage des chèvres, des incendies criminels (pour améliorer les pâturages) et l'expansion du réseau routier. La zone présente une riche végétation des espèces végétales rares. C'est une région d'une grande importance pour la protection. Il accueille également une grande variété d'oiseaux, de reptiles et d'amphibiens, comme Monachus monachus et Lézard d'Ikaria (Lacerta oertzeni oertzeni).
Il ya des plantes exceptionnelles dans ces zones protégées, comme Campanula hagielia, Centaurea raphanina mixta, Cephalaria squamiflora squamiflora, Corydalis intégration, elegans Dianthus, Digitalis cariensis, Erysimum senoneri icaricum, Fritillaria bithynica, Galanthus ikariae ikariae, Hypericum cuisinii, Muscari macrocarpum, Onopordum majorii, Polygonum icaricum, Ptilostemon gnaphaloides pseudofruticosus, Ranunculus thasius, Scutellaria rubicunda ikarica et Verbascum ikaricum.
Ces zones abritent également reptiles exceptionnels, amphibiens et les mammifères, tels que Monachus monachus, Myotis emarginatus, Rhinolophus blasii, Tursiops truncatus, Ablepharus kitaibelii fabichi, Agama stellio daani, Bufo viridis viridis, Coluber caspius, Cyrtodactylus kotschyi adelphiensis, Malpolon monspessulanus insignitus, Mauremys caspica rivulata, Ophisops elegans Macrodactylus et Ophisaurus apodus thracius.